西元1979年 菲萊神廟作為“阿布辛拜勒至菲萊的努比亞遺址”這一項目的組成部分，入選世界遺產名錄。與金字塔同時成為埃及的第一批世界文化遺產。
聯合國教科文組織世界遺產中心的評價為：這一重要區域有大量極具考古價值的宏偉古跡，包括阿布辛拜勒(Abu Simbel)的拉美西斯二世神廟(Temples of Ramses II)和菲萊(Philae)的伊希斯女神聖殿(Sanctuary of Isis)。這些古跡在1960至1980年間曾險遭尼羅河漲水毀壞，多虧聯合國教科文組織發起的國際運動，最終才倖免於難。
在埃及有許多建築精美的廟宇，每一個都有著自己的故事，而菲萊神廟這座供奉一位女性的神坻，顯得格外突出，萊神廟是供奉底比斯三神：伊西斯、奧西裏斯、荷魯斯，她婉婉的訴說著一個美麗的傳說。
菲萊神殿是祭祀埃及神話中愛情與生育女神伊西絲（Isis）的聖所。神殿的石柱石壁上佈滿了陰刻的圖畫與文字，其中有太陽船，鷹頭人身少年和女神哺嬰的畫像。伊西絲有過一段悲情。她的丈夫冥王歐賽利斯（Osiris）被其孿生兄弟瑟斯（Seth）殺害並分屍十六塊秘密拋撒在各地。痛苦中，伊西絲四處尋找丈夫的遺體，愛情的力量終於讓她收齊了丈夫的零碎身軀並在菲萊島上找到了他的頭顱。她縫合了屍體，使用魔力讓她丈夫復活，後來還為他生下了兒子鷹神霍拉斯（Horus）。 霍拉斯長大後為父報仇殺死了瑟斯。古埃及人崇拜這位女性，崇拜這位忠貞的妻子和偉大的母親，便在這個找到她丈夫的頭顱並生下她兒子的菲萊島上建立了供奉她的殿堂。至今，遊客還可以看到她的產房，看到她剖腹產生下兒子霍拉斯的石壁浮雕，以及霍拉斯長大後的塑像。
神廟原本在尼羅河菲萊島上，修築阿斯旺大壩之後神廟一度被水淹沒，為了保護這組被稱為“古埃及國王寶座上的明珠”的珍貴建築群不被損壞，從1972年起埃及政府在菲萊島周圍築壩排水，並將神廟拆卸，於1979年在距離原址 一公里 外的阿吉勒基亞島上按原樣組裝。神廟周圍的水庫區裏多的是巨石橫疊寸草不生的荒島，獨有神廟所在的島綠樹環抱鳥語花香，加上一座精美的古代神廟佇立其中，與周遭荒島截然不同。而菲萊島上的圖拉真皇帝的涼亭建於西元二世紀。柱子上有漂亮的植物裝飾柱頭。裏面四面刻有浮雕，講述伊西斯女神的故事。法老杖擊荷魯斯的敵人是典型的古埃及藝術場景，伊西斯女神被刻在入口的兩側。
西塔（左邊）的第一間小門通往托勒密六世的出生房。菲萊神廟的石柱柱頂造型各不相同，有蓮花、紙莎草、花萼和棕櫚葉，這是希臘時期建築的特徵。菲萊神廟無不體現著古埃及神廟的神秘和瑰麗，牆壁上留下的每一個痕跡好像都隱藏著自己的故事，而菲萊神廟就在阿吉勒基亞島上婉婉訴說著這個來世今生的美麗傳說。
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